Theo Công văn số 1506/TCT-CS ngày 18 tháng 04 năm 2019, trường hợp doanh nghiệp trong tháng/quý vừa có hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu, vừa có hàng hóa, dịch vụ bán trong nước thì doanh nghiệp phải hạch toán riêng số thuế GTGT đầu vào sử dụng cho sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu (kể cả tài sản cố định).
Trường hợp doanh nghiệp không hạch toán riêng được thì số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu được xác định theo tỷ lệ giữa doanh thu của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu trên tổng doanh thu hàng hóa, dịch vụ của các kỳ khai thuế GTGT tính từ kỳ khai thuế tiếp theo kỳ hoàn thuế liền trước đến kỳ đề nghị hoàn thuế hiện tại.
Số thuế GTGT đầu vào của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu (bao gồm số thuế GTGT đầu vào hạch toán riêng được và số thuế GTGT đầu vào được phân bổ theo tỷ lệ doanh thu) nếu sau khi bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hàng hóa, dịch vụ bán trong nước còn lại từ 300 triệu đồng trở lên thì được xét hoàn và số thuế được hoàn tối đa không vượt quá 10% doanh thu của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu.
